Služba za sredstva za zaštitu bilja ustrojena je unutar Sektora fitosanitarne politike u Upravi kvalitete hrane i fitosanitarne politike Ministarstva poljoprivrede. Unutar službe ustrojena su dva odjela. Odjel za sredstva za zaštitu bilja i Odjel za održivu uporabu pesticida.
Odjel za sredstva za zaštitu bilja nadležan je za pripremu prijedloga propisa o stavljanju na tržište sredstava za zaštitu bilja. U nadležnosti ovoga Odjela su i sljedeći poslovi:
registracija sredstava za zaštitu bilja,
proširenje i ograničenje uporaba sredstvima za zaštitu bilja,
proširenje odobrenja za male kulture i male namjene,
izdavanje dozvola za istraživanje i razvoj sredstvima za zaštitu bilja,
izdavanje dozvola za paralelnu trgovinu sredstava za zaštitu bilja,
izdavanje dozvola sredstvima za zaštitu bilja u hitnim situacijama,
izdavanje odobrenja za primjenu pesticida iz zraka (aviona, helikoptera),
koordinacija poslova registracije sredstava za zaštitu bilja i razmjena informacije s nadležnim zavodima i ostalim stručnim i znanstvenim institucijama,
vođenje upisnika i evidencija te izrada izvješća,
unos podataka u Fitosanitarni informacijski sustav (FIS) i održavanje i upravljanje bazama podataka te objavljivanje podataka na Fitosanitarni portal,
sudjelovanje u pripremi i provedbi projekata Europske unije i drugih projekata iz svog djelokruga,
suradnje i razmjene informacija s nadležnim službama drugih država, Europskom komisijom i s međunarodnim organizacijama i udruženjima nadležnim za sredstva za zaštitu bilja,
sudjelovanje u definiranju ciljeva i izradi planova iz svog djelokruga rada,
izrada stručnih naputaka i mišljenja te priprema i davanje odgovora,
ostali upravni i stručne poslovi iz područja sredstava za zaštitu bilja.
Odjel za održivu uporabu pesticida nadležan je za pripremu prijedloga propisa iz područja ostataka pesticida u hrani i održive uporabe pesticida. U nadležnosti ovoga Odjela su i sljedeći poslovi:
priprema i koordinacija godišnjih programa praćenja (monitoringa) ostataka pesticida u hrani
priprema i koordinacija godišnjih programa postregistracijske kontrole sredstava za zaštitu bilja (monitoringa formulacija),
izrada godišnjih izvješća o provedenim monitorinzima,
provodi mjere predviđene Nacionalnim akcijskim planom za postizanje održive uporabe pesticida 2013. – 2023. i prati ostvarenje predviđenih ciljeva,
promovira alternative kemijskim mjerama zaštite bilja od štetnika, bolesti i korova,
ovlašćivanje predavača za provedbu izobrazbe za sigurno rukovanje i primjenu sredstava za zaštitu bilja,
ovlašćivanje institucija za provedbu izobrazbe za sigurno rukovanje i primjenu sredstava za zaštitu bilja
ovlašćivanje ispitnih stanica za pregled strojeva za primjenu pesticida (prskalica i raspršivača),
vođenje upisnika i evidencija te izrada izvješća,
unos podataka u Fitosanitarni informacijski sustav (FIS) i održavanje i upravljanje bazama podataka te objavljivanje podataka na Fitosanitarni portal,
provjera zaprimljenih e-Obazaca za upis u Upisnik distributera i e-Obrazaca za prijavu prodaje sredstava za zaštitu bilja na kontrolnom sučelju FIS-a, njihova obrada i prihvaćanje,
sudjelovanje u pripremi i provedbi projekata Europske unije i drugih projekata iz svog djelokruga,
suradnje i razmjene informacija s nadležnim službama drugih država, Europskom komisijom i s međunarodnim organizacijama i udruženjima nadležnim za sredstva za zaštitu bilja,
sudjelovanje u definiranju ciljeva i izradi planova iz svog djelokruga rada,
izrada stručnih naputaka i mišljenja te priprema i davanje odgovora,
ostali upravni i stručne poslovi iz područja ostataka pesticida i održive uporabe pesticida.